La historia de los Atholl Highlanders está directamente ligada a los antiguos clanes y tradiciones de las Highlands Escocesas y en particular está conectado al gran clan Donnachaidh de quien Atholl era su jefe. 
Antes de la Unión de las Coronas en 1603, el rey de los escoceses no tenía un ejército propio y confiaba en las fuerzas que poseían los jefes de otros clanes. La más importante intervención de este ejército fue en 1706 cuando el Duque de Atholl se opuso a la Unión con Inglaterra. En ese entonces, contaba con una fuerza total de 4.000 hombres.

La Rebelión Jacobita
En 1715 más de 1.400 hombres integraron cuatro regimientos. En 1745 el hijo del primer duque volvió de Francia con Bonnie Prince Charlie mientras que su hermano George Murray se desempeñaba como comandante en jefe del ejército jacobita. 

La Guerra de la Independencia Americana
En 1775 el coronel James Murray, tío del cuarto duque, se ofreció para participar en la guerra de la Independencia Americana con una fuerza de 1.000 hombres pero, cuando el ejército estaba por embarcar, la guerra termina y fueron comisionados a Irlanda hasta 1782. 
Posteriormente se les ordena dirigirse a la India, pero, como no se renueva su contrato ni tampoco se les paga, el ejército marcha a Berwick en donde se separa.

La Reina Victoria
El nieto del cuarto duque Lord Glenlyon quien después se convirtió en sexto duque, fue el responsable de la creación de este ejército en su forma actual. Cuando tuvo como invitada a la reina Victoria en 1842, seleccionó una guardia de 100 hombres de un total de 870 para escoltar a la reina a la otra residencia de la familia en Dunkeld. 
En 1844 le prestó el castillo a la reina Victoria por tres semanas, en las cuales la reina disfrutó de sus vacaciones. 
Victoria fue recibida con una guardia de honor en las puertas de entrada del castillo mientras que el resto del regimiento se encontraba frente al mismo. Esta fue la guardia permanente de la reina durante sus vacaciones en el castillo y al partir, Lord Glenlyon la acompaña a caballo hasta Dundee.

La Presentación de los Colores de la Reina.
Tal fue la impresión de la reina Victoria al visitar Blair Atholl que decide otorgar sus colores reales al regimiento en septiembre de 1845. Este acontecimiento los convierte en el único ejército privado del Reino Unido y de Europa hasta la actualidad. 

A través de los siglos XIX y XX los Atholl Highlanders desfilaron en varias ceremonias durante las visitas reales a Perthshire y al resto de Escocia. 

En ambas guerras mundiales, muchos Atholl Highlanders pelearon en Sudáfrica con el regimiento llamado "Scottish Horse" formado en 1901. 

En 1966 Iain Murray, décimo duque realizó cambios en la formación de su ejército el cual hoy, está integrado por una fuerza de 100 hombres de diferentes rangos.
El duque muere en 1996 y sus Atholl Highlanders, como guardias de honor, llevan su ataúd durante el funeral, encabezados por gaitas y tambores. 

Por Monica Loreto quien visitó Blair Castle en Julio de 2001.

Sesión de fotos de los Atholl Highlanders con música.